THÔNG TIN MÔ TẢ
Khám phá toàn diện clonotype đặc hiệu kháng nguyên chỉ trong một tuần
BEAM (Barcode Enabled Antigen Mapping) là quy trình sàng lọc kháng nguyên đa kênh cho phép phát hiện nhanh chóng các clonotypes tế bào B (BEAM-Ab) và tế bào T (BEAM-T) đặc hiệu của kháng nguyên. Giải pháp có khả năng thu được toàn diện thông tin của hồ sơ tế bào đặc hiệu kháng nguyên, bao gồm các chuỗi V(D)J ghép đôi có độ dài đầy đủ, biểu hiện gen và protein bề mặt tế bào. Dựa vào thông tin thu được, các tế bào T và B hiếm phản ứng đặc hiệu với kháng nguyên có thể được phát hiện, tạo điều kiện đẩy nhanh quá trình khám phá liệu pháp miễn dịch mới.
Phát hiện nhanh tế bào B và T
BEAM-Ab
Biến đổi quá trình khám phá kháng thể bằng quy trình nhanh vượt bậc, sử dụng công nghệ đa kênh để sàng lọc độ đặc hiệu của đồng thời nhiều kháng nguyên với hàng nghìn tế bào B đơn lẻ
- Quy trình từ mẫu đầu vào đến phát hiện kháng thể đặc hiệu diễn ra trong chưa đầy 1 tuần
- Sàng lọc song song tối đa 15 kháng nguyên để tạo ra hàng chục đến hàng trăm lượt tiếp cận trên mỗi mẫu
- Dễ dàng xác định các kháng thể lý tưởng cho quá trình xác nhận tiếp theo
BEAM-T
Antigen-specific T cells don’t have to be hard to find anymore. Map antigens to T-cell receptors with off-the-shelf ease and unparalleled cellular characterization.
BEAM-T giải quyết các khó khăn trước giờ trong vấn đề tìm các tế bào T đặc hiệu với kháng nguyên. Giải pháp cho phép chúng ta lập bản đồ các kháng nguyên tới các thụ thể tế bào T một cách dễ dàng, xác định đặc tính của các tế bào một cách vượt trội .
- Tận dụng các bộ kit MHC monomers có sẵn trên thị trường để chuẩn bị phức hợp peptide-MHC chỉ trong vài phút.
- Thiết kế và tìm nguồn peptide từ bất kỳ nhà cung cấp nào để tăng tính linh hoạt tối đa.
- Phát hiện các clonotypes hiếm của TCR và/hoặc có liên quan về mặt trị liệu với biểu hiện gen ở cấp độ phân giải tế bào đơn.
Quy trình làm việc
Chuẩn bị mẫu
Đánh dấu tế bào của bạn bằng tập hợp kháng nguyên đã được gắn barcode dựa theo hướng dẫn sử dụng về quy trình chuẩn bị mẫu. Quần thể tế bào đặc hiệu của kháng nguyên có thể được làm giàu thông qua quá trình flow cytometry. Huyền phù tế bào tương thích bao gồm các mẫu từ PBMC, tế bào B, tế bào T, tế bào lá lách chuột, v.v.
Tạo thư viện 10x
Bằng việc sử dụng các bộ kit thuốc thử và thiết bị Chromium tương thích của 10x Genomics thì vi giọt tế bào đơn được tạo ra mà trong mỗi vi giọt, quá trình phiên mã ngược diễn ra để tạo ra các cDNA mang chung một 10x barcode đến từ tế bào ban đầu.
Giải trình tự
Thư viện được gắn 10x barcode tương thích với việc phân tích dữ liệu giải trình tự đoạn đọc ngắn của Illumina, cho phép lập hồ sơ miễn dịch và phiên mã hàng nghìn tế bào đơn.
Phân tích dữ liệu
Cell Ranger cho phép người dùng phân tích dữ liệu thu được từ biểu hiện gen, trình tự các thụ thể miễn dịch được ghép cặp, protein bề mặt tế bào và tính đặc hiệu của kháng nguyên.
Trực quan hóa dữ liệu
Loupe V(D)J Browser được sử dụng để xác định và so sánh các loại tế bào dựa trên biểu hiện gen và các loại marker khác nhau.
