THÔNG TIN MÔ TẢ
Thực hiện phân tích thông tin biểu hiện gen toàn bộ hệ phiên mã với độ phủ liên tục trên lát cắt mô.
Cung cấp vị trí chính xác của từng bản phiên mã với quy trình tích hợp sử dụng Visium CytAssist để tạo ra dữ liệu phiên mã không gian chất lượng cao nhất.
Cung cấp dữ liệu mạnh mẽ từ các mẫu FFPE của người hoặc chuột, bao gồm cả các khối mô lưu trữ từ trước hoặc các lát cắt mô sẵn.
Nâng cao hình ảnh nhuộm H&E và iF của mẫu bằng giải pháp phân tích không gian hệ phiên mã với độ phân giải cao trên cùng một lát cắt mô.
Lam kính Visium HD
Cải tiến về cấu trúc lam kính cho phép độ phân giải ở mức độ tế bào đơn.
Lam kính Visium HD Spatial Gene Expression có 2 vùng bắt giữ với kích thước 6.5 x 6.5 mm với một mạng lưới liên tục các oligonucleotide được sắp xếp trong hàng triệu ô vuông 2 x 2 µm được mã hóa với các mã vạch và không có khoảng cách, từ đó tạo nên độ phân giải ở mức tế bào đơn. Dữ liệu được xuất ra ở kích thước 2 µm, cũng như nhiều kích thước ô khác nhau. Kích thước ô 8 x 8 µm là điểm khởi đầu được khuyến cáo cho việc trực quan hóa và phân tích dữ liệu.
Những câu hỏi thường gặp
Cấu trúc vùng bắt giữ trên lam kính Visium HD là như thế nào?
Loại mẫu nào tương thích với Visium HD?
Visium HD tương thích với các mẫu mô FFPE chứa mRNA của người và chuột. Bao gồm cả các khối mô FFPE được lưu trữ từ trước hoặc các lát cắt mô sẵn. Chúng tôi có kế hoạch mở rộng mức độ tương thích với nhiều loại mô khác nhau nữa trong tương lai.
Loại phương pháp nhuộm nào sẽ tương thích với quy trình Visium HD?
Visium HD Spatial Gene Expression tương thích với phương pháp nhuộm hematoxylin and eosin (H&E) cung cấp thông tin về hình thái mô và phương pháp nhuộm miễn dịch huỳnh quang (IF) để đồng thời phát hiện protein.
Làm cách nào để phân tích dữ liệu từ Visium HD Spatial Gene expression?
10x Genomics cung cấp hai giải pháp phần mềm để giúp bạn có thể phân tích dữ liệu: Space Ranger và Loupe Browser. Space Ranger là một phần mềm phân tích tự động, tự động gán thông tin biểu hiện gen không gian lên hình ảnh mẫu mô của bạn và xác định các cụm ô vuông được mã vạch có các hồ sơ biểu hiện tương tự. Sau đó, bạn có thể sử dụng Loupe Browser, một phần mềm trực quan hóa, để khám phá kết quả một cách tương tác hơn.
