Spatial Gene + Protein Expression

Visium CytAssist Spatial Gene and Protein Expression

Phân tích dữ liệu mô với thông tin phiên mã và protein cùng lúc

Kết hợp phân tích thông tin không gian toàn bộ hệ phiên mã và phát hiện nhiều mục tiêu protein cùng lúc với công nghệ NGS trên cùng một lát cắt mô. Cung cấp cái nhìn sâu sắc, toàn diện hơn về tổ chức mô, sử dụng Visium CytAssist để tăng độ tương thích với nhiều loại mẫu và tối ưu hóa quy trình.

Danh mục:

THÔNG TIN MÔ TẢ

Tối đa hóa hiểu biết của bạn: Cung cấp cái nhìn sâu sắc, toàn diện hơn về mẫu mô của bạn với các thông tin về protein, mRNA và hình thái trên cùng một lát cắt mô.

Đánh giá toàn bộ lát cắt mô: Trực quan hóa thông tin protein và biểu hiện toàn bộ hệ phiên mã mà không cần phải lựa chọn các khu vực quan tâm..

Phân tích dữ liệu một cách liền mạch: Kết hợp dữ liệu protein cùng dữ liệu biểu hiện gen trên phần mềm thân thiện với người dùng.

Thông tin đa dạng

  • Phân tích được nhiều mục tiêu multiomics chỉ trên cùng một lát cắt mô- Nghiên cứu đồng thời protein và RNA trên cùng một lát cắt bằng cách sử dụng panel kháng thể đã được chọn lọc và kiểm tra từ trước
  • Các vấn đề về hình thái học – Chỉ một phương pháp phân tích đa chỉ tiêu protein cho phép bạn thu nhận hình ảnh được nhuộm H&E hoặc IF trước khi tiến hành các xử lý hóa học khác
  • Khám phá không thiên vị – Phân tích biểu hiện gen không thiên vị toàn bộ hệ phiên mã và không cần chọn vùng quan tâm với các chỉ số sinh học đã xác định từ trước

Spatially resolved gene expression and protein detection in the mouse brain

Câu hỏi thường gặp

Visium CytAssist Gene and Protein Expression là gì?

Visium CytAssist Spatial Gene and Protein Expression được thiết kế để phân tích đồng thời biểu hiện gen và biểu hiện protein trên mẫu mô FFPE và được tích hợp sử dụng với thiết bị Visium CytAssist. Phương pháp sử dụng NGS để xác định sự đa dạng của các kháng thể được gắn oligo với độ phân giải không gian, bên cạnh toàn bộ hệ phiên mã và hình ảnh hình thái học..

Làm sao để sử dụng dữ liệu biểu hiện protein để hiểu hơn về mẫu mô bạn quan tâm?

Giải pháp Visium CytAssist Gene and Protein Expression của chúng tôi cho phép các nhà nghiên cứu tìm hiểu mức độ biểu hiện tương đối của các protein trong panel Human Immune Cell Profiling. Việc sử dụng phân tích dữ liệu biểu hiện proetin bằng NGS cho phép bạn vượt qua những thách thức như sự chồng chéo phổ và hạn chế về loài vi khuẩn của kháng thể, điều này thường dẫn đến hạn chế về số lượng protein có thể được nghiên cứu đồng thời trong mẫu mô. Hơn nữa, điều này cho phép người dùng nhận biết các chỉ thị protein miễn dịch mà thông thường được biểu hiện thấp hơn so với RNA.

Các kháng thể nào có trong panel 10x Human Immune Cell Profiling?

Panel của chúng tôi bao gồm 35 kháng thể từ Abcam và Biolegend, bao gồm các protein trên bề mặt và bên trong tế bào. Để biết danh sách các kháng thể bao gồm, vui lòng xem danh sách Kháng thể trên trang Support.

Làm sao để phân tích dữ liệu từ giải pháp Visium CytAssist Gene and Protein Expression?

10x Genomics cung cấp hai giải pháp phần mềm để giúp bạn có thể phân tích dữ liệu: Space Ranger và Loupe Browser. Space Ranger là một phần mềm phân tích tự động, tự động gán thông tin biểu hiện gen không gian lên hình ảnh mẫu mô của bạn và xác định các cụm ô vuông được mã vạch có các hồ sơ biểu hiện tương tự. Sau đó, bạn có thể sử dụng Loupe Browser, một phần mềm trực quan hóa, để khám phá kết quả một cách tương tác hơn.

Phương pháp nhuộm IF và Visium có khác biệt so với nhuộm IF thông thường không?

Có, có một vài sự khác biệt  giữa quy trình nhuộm IF thông thường và quy trình nhuộm IF kết hợp với Visium. Vui lòng tham khảo quy trình IF Demonstrated Protocol (FFPE | Fresh frozen) để có thêm chi tiết.

Nhuộm IF có ảnh hưởng đến dữ liệu biểu hiện gen Visium không?

Ảnh hưởng của hiệu năng Visium có thể thay đổi trên những mô khác nhau do độ nhạy cao của giải pháp. Tuy nhiên, tổ chức không gian của biểu hiện gen và tính năng phân cụm tế bào thì vẫn tích hợp được với quy trình nhuộm H&E hoặc IF.

GeneSmart tự hào là đơn vị tiên phòng đầu tiên tại Việt Nam cung cấp giải pháp:

1. Giải trình tự tế bào đơn (SINGLE-CELL SEQUENCING);

2. Chuẩn bị mẫu tự động (AUTOMATED LIQUID HANDLING);

3. Xét nghiệm và chẩn đoán bệnh nhiễm (DIAGNOSIS OF INFECTIOUS DISEASE);

4. Sinh chiết lỏng (LIQUID BIOPSY)

5. Giải phẫu bệnh sinh học phân tử (MOLECULAR PATHOLOGY)

6. Nghiên cứu ung thư (CANCER RESEARCH)

7. Nghiên cứu miễn dịch (IMMUNOLOGY)

8. Khoa học hình sự (FORENSIC)

9. Trữ mẫu sinh học (Ngân hàng sinh học, BIOBANKING)

-----------------------

CÔNG TY TNHH KHOA HỌC CÔNG NGHỆ GENESMART (MST: 0315672982)

Địa chỉ: 58-60 Hòa Bình (Tòa nhà Hòa Bình), Tầng 4B, Phường 5, Quận 11, TP. Hồ Chí Minh.

Hotline: +84 947 528 778 | Website: https://genesmart.vn/

Email: [email protected] hoặc [email protected]