Novogene cung cấp dịch vụ toàn diện bao gồm các bước chiết xuất DNA, chuẩn bị thư viện, giải trình tự và phân tích cho dịch vụ Giải trình tự toàn bộ exome chuột (mWES). Những dịch vụ này giúp các nhà nghiên cứu phát hiện các đột biến gây bệnh ở chuột với các kiểu hình có thể phân biệt, từ đó phát hiện các gen liên quan đến bệnh ở người và làm rõ cơ chế tiến hóa kháng thuốc trong các mô hình chuột.
Ứng dụng
Giải trình tự toàn bộ exome chuột đã giúp các nhà nghiên cứu làm rõ các cơ chế sau:
- Phát triển thuốc trong điều trị ung thư
- Nghiên cứu mô hình về sức khỏe và bệnh tật ở người
Lợi ích
- Agilent SureSelectXT Mouse Exon Kit và nền tảng NovaSeq 6000 có sẵn cho dịch vụ mWES.
- Chất lượng dữ liệu được đảm bảo với Q30≥85%.
- Độ bao phủ trung bình của vùng mục tiêu đạt tỷ lệ 99.6+/- đối với mWES.
- Dữ liệu sẵn sàng công bố và các biểu đồ phân tích cung cấp cái nhìn tổng quan về kết quả dựa trên quy trình phân tích sinh tin học tiên tiến và cơ sở dữ liệu của Novogene.
Thông số kỹ thuật: Yêu cầu mẫu
| Loại mẫu | Lượng cần (Qubit®) | Độ tinh khiết |
|---|---|---|
| DNA hệ gen | ≥ 300 ng | A260/280 = 1.8-2.0; không phân hủy, không nhiễm tạp |
| DNA từ mô cố định parafin (FFPE) | ≥ 500 ng | Đoạn DNA dài hơn 1000 bp |
Thông số kỹ thuật: Giải trình tự và phân tích
- Nền tảng: Illumina NovaSeq 6000
- Chiều dài đọc: Paired-end 150 bp
- Độ sâu giải trình tự đề xuất: Độ sâu giải trình tự hiệu quả trên 50× (6G)
Phân tích dữ liệu chuẩn
- Kiểm soát chất lượng dữ liệu
- Căn chỉnh với hệ gen tham chiếu, thống kê chiều sâu ánh xạ và độ bao phủ
- Phát hiện SNP và InDel, chú thích và thống kê
- Phát hiện đột biến somatic SNP/InDel/CNV (trong mẫu ghép đôi bình thường – khối u)
Quy trình thực hiện dự án
Quy trình thực hiện bao gồm các bước từ chuẩn bị mẫu, xây dựng thư viện, giải trình tự DNA đến kiểm soát chất lượng dữ liệu và phân tích sinh tin học. Novogene cam kết cung cấp sản phẩm chất lượng cao và dịch vụ chuyên nghiệp, tuân thủ các tiêu chuẩn khoa học nghiêm ngặt để đảm bảo kết quả nghiên cứu chính xác và chất lượng.
