Single Cell Gene Expression

Biểu hiện Gen Đơn Bào (Single Cell Gene Expression)

So với giải trình tự phiên mã số lượng lớn (bulk transcriptome sequencing), giải trình tự đơn bào (single-cell sequencing) cho thấy được toàn bộ sự phức tạp trong đa dạng tế bào. Phương pháp này giải quyết hiệu quả các thách thức trong việc nghiên cứu:

  • Các loại tế bào hiếm
  • Mối quan hệ phả hệ tế bào
  • Các mẫu sinh học có tính không đồng nhất cao

Từ đó, giúp phân tích chức năng của từng tế bào riêng lẻ một cách chính xác. Thông qua phân tích đơn bào chuyên sâu, các nhà nghiên cứu có thể phát hiện mục tiêu điều trị và dấu ấn sinh học (biomarkers) mới một cách hiệu quả, từ đó thúc đẩy những khám phá khoa học vượt bậc.

Danh mục:

Novogene cung cấp dịch vụ giải trình tự đơn bào toàn diện từ đầu đến cuối, bao gồm:

  • Biểu hiện gen 3’ đơn bào (Single Cell 3′ Gene Expression)
  • Biểu hiện gen 5’ đơn bào (Single Cell 5′ Gene Expression)
  • Lập hồ sơ miễn dịch đơn bào (Single Cell Immune Profiling)
  • Giải trình tự ATAC đơn bào (Single Cell ATAC), v.v.

Chúng tôi hỗ trợ toàn diện cho dự án của bạn từ tư vấn thiết kế thí nghiệm, dịch vụ tại chỗ*, chuẩn bị thư viện, giải trình tự thế hệ mới (NGS), đến báo cáo phân tích tin sinh học.

Là nhà cung cấp dịch vụ được chứng nhận của 10x Genomics và nền tảng Illumina NGS, bạn hoàn toàn có thể tin tưởng vào chất lượng và độ tin cậy cao nhất trong quy trình giải trình tự đơn bào của chúng tôi.

* Dịch vụ bắt tế bào tại chỗ hiện chỉ áp dụng cho khách hàng tại Singapore và Nhật Bản.

Ứng dụng

  • Biểu hiện gen đơn bào: Lập hồ sơ về tính không đồng nhất tế bào, phát hiện mục tiêu điều trị mới và biomarker trong từng tế bào từ một quần thể dị biệt.
  • Lập hồ sơ miễn dịch đơn bào: Phân tích các thụ thể B hoặc T tế bào toàn chiều dài và có cặp, đặc hiệu kháng nguyên, và biểu hiện gen – tất cả từ cùng một tế bào.
  • ATAC đơn bào: Phân tích khả năng tiếp cận nhiễm sắc thể ở cấp độ đơn bào, cung cấp cái nhìn sâu sắc về loại và trạng thái tế bào, đồng thời làm sáng tỏ cơ chế điều hòa gen.

* Dịch vụ ATAC đa omics đơn bào không được cung cấp.

Yêu cầu mẫu

Loại mẫu Dịch vụ Số lượng mẫu Độ sống tế bào
Huyền phù tế bào đơn tươi Dịch vụ tại chỗ* Tế bào đơn ≥ 1.000.000 Viability ≥ 80%, Đường kính: 5–30 μm
Huyền phù nhân tế bào* Dịch vụ tại chỗ* Tế bào đơn ≥ 1.000.000 Viability ≥ 80%, Đường kính: 5–30 μm
Huyền phù tế bào đơn đông lạnh** Gửi bằng đá khô Tế bào đơn ≥ 1.000.000 Viability ≥ 80%, Đường kính: 5–30 μm

* Dịch vụ tại chỗ chỉ áp dụng cho khách hàng tại Singapore và Nhật Bản. Huyền phù nhân tế bào chỉ áp dụng cho dịch vụ tại chỗ.

** Vui lòng tải xuống và điền vào mẫu đơn nếu bạn gửi mẫu tế bào đơn đông lạnh cho chúng tôi.

Specifications: Sequencing & Analysis

Sequencing Platform NovaSeq 6000 or NovaSeq X Plus
Read length Pair-end 150bp
Recommended Data 20,000 – 50,000 read pairs/cell, around 120Gb/sample
Analysis  Cell Ranger Analysis Standard Analysis
  • Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs.
  • Summary metrics (sequencing quality, number of cells detected, the mean reads per cell, and the median genes detected per cell et al.).
  • Alignment of reads to genome.
  • Gene expression quantification.
  • Clustering analysis.
  • Differentially expression analysis between clusters.
  • Visualization.
  • Demultiplex BCL files from a sequencer into FASTQs.
  • Alignment, UMI counting, Metrics summary.
  • Identification of highly variable gene (HVGs).
  • Cell Subpopulation Identification.
    Principal component analysis (PCA).
    Identify clusters of cells.
    Dimensionality reduction and Visualization.
  • Marker gene detection (Differentially expression analysis between clusters).
  • GO/KEGG/Reactome Enrichment.
    FunctionalAnnotation of Transcription Factor.
    Protein-Protein Interaction Network Analysis.

Quy trình thực hiện dự án

Chúng tôi cung cấp gói dịch vụ toàn diện từ đầu đến cuối nhằm đảm bảo khách hàng nhận được dữ liệu chất lượng cao nhất – bao gồm:

  • Tư vấn trước dự án với các chuyên gia ứng dụng trong thiết kế thí nghiệm
  • Chuẩn bị mẫu, xây dựng thư viện, giải trình tự, kiểm soát chất lượng dữ liệu
  • Phân tích tin sinh học chuyên sâu

Single Cell Gene ExpressionGói phân tích tiêu chuẩn của chúng tôi bao gồm xác định các quần thể tế bào riêng biệt và phân tích biểu hiện gen khác biệt, cung cấp cho các nhà nghiên cứu những hiểu biết sâu sắc để thúc đẩy các khám phá khoa học.
Với pipeline phân tích Cell Ranger, chúng tôi xử lý dữ liệu giải trình tự thô bằng quy trình kiểm soát chất lượng nghiêm ngặt, căn chỉnh chính xác và định lượng đáng tin cậy – chuyển đổi dữ liệu phức tạp thành thông tin có thể hành động.

Chúng tôi có kinh nghiệm phong phú với hơn 300 loài và loại mẫu sinh học, từ các sinh vật mô hình phổ biến cho đến những loài quý hiếm và độc đáo như Hổ Siberi, Rùa, và Cá Phổi. Chính sự đa dạng này là nền tảng để chúng tôi mang lại kết quả phân tích mạnh mẽ và đáng tin cậy cho mọi dự án nghiên cứu.

GeneSmart tự hào là đơn vị tiên phòng đầu tiên tại Việt Nam cung cấp giải pháp:

1. Giải trình tự tế bào đơn (SINGLE-CELL SEQUENCING);

2. Chuẩn bị mẫu tự động (AUTOMATED LIQUID HANDLING);

3. Xét nghiệm và chẩn đoán bệnh nhiễm (DIAGNOSIS OF INFECTIOUS DISEASE);

4. Sinh chiết lỏng (LIQUID BIOPSY)

5. Giải phẫu bệnh sinh học phân tử (MOLECULAR PATHOLOGY)

6. Nghiên cứu ung thư (CANCER RESEARCH)

7. Nghiên cứu miễn dịch (IMMUNOLOGY)

8. Khoa học hình sự (FORENSIC)

9. Trữ mẫu sinh học (Ngân hàng sinh học, BIOBANKING)

-----------------------

CÔNG TY TNHH KHOA HỌC CÔNG NGHỆ GENESMART (MST: 0315672982)

Địa chỉ: 65-67 Đường Số 5 - Cư xá Bình Thới, Phường 8, Quận 11, Thành phố Hồ Chí Minh.

Hotline: +84 947 528 778 | Website: https://genesmart.vn/

Email: [email protected] hoặc [email protected]

Download Flyer

Sản phẩm tương tự

Menu Ẩn
Search Icon