Dịch vụ giải trình tự RNA nhỏ (sRNA-seq) của Novogene là một phương pháp hiệu quả để chọn lọc nhắm mục tiêu vào bất kỳ loại RNA nhỏ (sRNA) nào với độ nhạy chưa từng có và độ phân giải cao – tất cả trong một lần phân tích duy nhất. Kết hợp với hệ thống pipeline tin sinh học nội bộ mạnh mẽ, dịch vụ sRNA-seq của Novogene đã hỗ trợ các nhà nghiên cứu mô tả sự khác biệt trong biểu hiện của miRNA, các biến đổi cấu trúc, và khám phá các RNA nhỏ mới.
Ứng dụng
sRNA-seq đang hỗ trợ nhiều hướng nghiên cứu đầy tiềm năng, bao gồm:
- Lập hồ sơ các bản phiên mã đã biết và mới, cùng với định lượng biểu hiện của RNA nhỏ
- Dự đoán các gen đích của các ứng viên miRNA
- Xác định các dấu ấn sinh học đặc hiệu cho mô, giai đoạn phát triển, hoặc loại tế bào, phục vụ cho chẩn đoán và phân loại ung thư/bệnh
- Khám phá mạng lưới điều hòa và làm sáng tỏ cơ chế phát triển mô hoặc sinh vật dựa trên hồ sơ phiên mã
Lợi ích
Dịch vụ sRNA-seq của Novogene là một dịch vụ đã được kiểm chứng với kinh nghiệm phong phú và hàng loạt mẫu đã được giải trình tự thành công. Dịch vụ này cung cấp khả năng truy cập vào các hồ sơ biểu hiện và mô tả phiên mã của nhiều loại RNA nhỏ, với quy trình xử lý mẫu đã được tối ưu hóa cho cả RNA toàn phần (total RNA) và RNA ngoại bào (exosomal RNA).
Novogene cung cấp các phân tích toàn diện bằng phần mềm hiện đại và pipeline nội bộ trưởng thành, đáp ứng đầy đủ các nhu cầu tin sinh học của bạn. Các nhà nghiên cứu có thể thu được mạng lưới điều hòa, cơ chế điều hòa sâu của biểu hiện gen, và nhiều hơn nữa, với dịch vụ chất lượng cao từ Novogene.
Thông số kỹ thuật: Yêu cầu mẫu RNA
| Library Type | Sample Type | Amount | RNA Integrity Number (Agilent 2100) | Purity (NanoDrop) |
| Small RNA Library | Total RNA | ≥ 2 μg | Animal ≥ 7.5, Plant ≥ 7, with smooth baseline | A260/280 = 1.8-2.2 A260/230 ≥ 1.8 |
| Exosomal Small RNA Library | Exosomal RNA | ≥ 10 ng | Peak between 25-200 nt, FU> 10, no peak > 2000 nt |
Thông số kỹ thuật: Trình tự hóa và Phân tích
| Sequencing Platform | Illumina NovaSeq 6000 |
| Read Length | Single-end 50 bp |
| Recommended Sequencing Depth | ≥ 10 million read pair per sample |
| Standard Analysis (miRNA) | Data Quality Control
Summary of Length Distribution Common & Specific Sequence Summary Identification & Characterization of miRNAs Classification & Annotation of miRNA Quantification & Differential Expression Analysis Functional Enrichment Analysis |
Quy trình thực hiện dự án
Quy trình dự án bắt đầu bằng bước kiểm tra chất lượng mẫu (Sample QC) nhằm đảm bảo mẫu của bạn đáp ứng các tiêu chuẩn kỹ thuật của phương pháp sRNA-seq. Tiếp theo, thư viện sẽ được xây dựng phù hợp với sinh vật mục tiêu và ứng dụng nghiên cứu, sau đó được kiểm tra chất lượng (Library QC).
Sau khi hoàn thiện thư viện, quá trình giải trình tự được thực hiện theo chiến lược đọc đơn 50 bp (single-end 50 bp). Dữ liệu đầu ra từ quá trình giải trình tự cũng sẽ trải qua kiểm tra chất lượng dữ liệu (Data QC) để đảm bảo độ chính xác và độ tin cậy.
