Metatranscriptome Sequencing

Giải Trình Tự Metatranscriptome

Metatranscriptomics là lĩnh vực nghiên cứu chức năng của toàn bộ tập hợp transcript thông qua kỹ thuật giải trình tự RNA từ các mẫu môi trường tại một thời điểm cụ thể. Phương pháp này cho chúng ta biết những gen nào đang được biểu hiện mạnh mẽ nhất trong một môi trường vi sinh vật cụ thể, từ đó cung cấp cái nhìn sâu sắc về hoạt động sinh học và chức năng của cộng đồng vi sinh vật tại thời điểm khảo sát.

Danh mục:

Giải Trình Tự Metatranscriptome

Giải trình tự metatranscriptome cung cấp toàn bộ hồ sơ biểu hiện gen bằng cách giải trình tự ngẫu nhiên các mRNA, đồng thời theo dõi sự biến động của mô hình biểu hiện gen trong các cộng đồng vi sinh vật theo thời gian bằng công nghệ giải trình tự thế hệ mới (NGS). Phương pháp này giúp cải thiện hiểu biết của chúng ta về cấu trúc, chức năng và cơ chế thích nghi của các cộng đồng vi sinh phức tạp.

Ứng Dụng

  • Sinh thái học vi sinh vật: Hỗ trợ phân tích các vi khuẩn có hoạt tính chức năng và mối tương tác chuyển hóa giữa các thành viên trong cộng đồng vi sinh.
  • Nghiên cứu lâm sàng: Nhận diện đáp ứng miễn dịch và các quá trình tự miễn dịch.
  • Khám phá thuốc: Mở ra cơ hội tìm kiếm nguồn tài nguyên sinh học mới cho nghiên cứu và phân phối thuốc, vượt qua giới hạn kỹ thuật trong việc phân lập vi sinh vật.
  • Công nghiệp thực phẩm: Cải thiện chất lượng thực phẩm và cung cấp dữ liệu liên quan đến hành vi chuyển hóa của cộng đồng vi sinh vật.

Lợi Ích

  • Cho phép lập hồ sơ transcriptome của cộng đồng tự nhiên mà không cần phải phân lập hoặc nuôi cấy vi sinh vật.
  • Xác định gen mới và phát hiện sự thay đổi biểu hiện ở mức độ phiên mã trong các cộng đồng vi sinh vật phức tạp.

Thông Số Kỹ Thuật: Yêu Cầu Mẫu RNA

Loại thư viện Loại mẫu Lượng RNA RNA Integrity Number (Agilent 2100) Độ tinh khiết (NanoDrop)
Thư viện metatranscriptome Tổng RNA ≥ 1 μg ≥ 6.5, đường nền mượt A260/280 ≥ 2.0; A260/230 ≥ 2.0

Thông Số Kỹ Thuật: Giải Trình Tự & Phân Tích

  • Nền tảng giải trình tự: Hệ thống Illumina NovaSeq 6000
  • Chiều dài đoạn đọc: Paired-end 150 bp
  • Số lượng dữ liệu khuyến nghị: ≥ 20 triệu cặp đọc mỗi mẫu

Nội dung phân tích dữ liệu bao gồm:

  • Kiểm tra chất lượng dữ liệu (Data QC)
  • Lắp ráp metatranscriptome
  • Chú thích chức năng gen
  • Phân tích phân loại rRNA & mRNA
  • Định lượng biểu hiện gen & phân tích biểu hiện khác biệt
  • Phân tích làm giàu chức năng (enrichment analysis)
  • So sánh chức năng giữa các mẫu

Quy Trình Dự Án

  1. Kiểm tra chất lượng mẫu (Sample QC) – đảm bảo mẫu đáp ứng tiêu chuẩn RNA-Seq.
  2. Chuẩn bị thư viện – tùy thuộc vào sinh vật mục tiêu.
  3. Kiểm tra chất lượng thư viện (Library QC)
  4. Giải trình tự bằng chiến lược paired-end 150 bp
  5. Kiểm tra chất lượng dữ liệu (Data QC)
  6. Phân tích tin sinh học – cung cấp kết quả sẵn sàng để công bố

Prokaryotic RNA Sequencing

GeneSmart tự hào là đơn vị tiên phòng đầu tiên tại Việt Nam cung cấp giải pháp:

1. Giải trình tự tế bào đơn (SINGLE-CELL SEQUENCING);

2. Chuẩn bị mẫu tự động (AUTOMATED LIQUID HANDLING);

3. Xét nghiệm và chẩn đoán bệnh nhiễm (DIAGNOSIS OF INFECTIOUS DISEASE);

4. Sinh chiết lỏng (LIQUID BIOPSY)

5. Giải phẫu bệnh sinh học phân tử (MOLECULAR PATHOLOGY)

6. Nghiên cứu ung thư (CANCER RESEARCH)

7. Nghiên cứu miễn dịch (IMMUNOLOGY)

8. Khoa học hình sự (FORENSIC)

9. Trữ mẫu sinh học (Ngân hàng sinh học, BIOBANKING)

-----------------------

CÔNG TY TNHH KHOA HỌC CÔNG NGHỆ GENESMART (MST: 0315672982)

Địa chỉ: 65-67 Đường Số 5 - Cư xá Bình Thới, Phường 8, Quận 11, Thành phố Hồ Chí Minh.

Hotline: +84 947 528 778 | Website: https://genesmart.vn/

Email: [email protected] hoặc [email protected]

Download Flyer

Sản phẩm tương tự

Menu Ẩn
Search Icon