Định hình tế bào đơn hệ multiomics với thông số cao chưa từng có
Xác định các huyền phù tế bào phức tạp bằng cách lập hồ sơ hàng trăm protein bề mặt tế bào cùng với biểu hiện gen của từng tế bào đơn. Giải pháp này cho phép chúng ta khám phá sâu vào từng tế bào trong các hệ thống sinh học phức tạp với độ phân giải vượt trội, mở ra cơ hội cho những đột phá khoa học được thực hiện
Quy trình làm việc
Chuẩn bị mẫu
Đánh dấu các tế bào của bạn bằng kháng thể TotalSeq™–B/C được liên hợp với oligonucleotide barcode. Quần thể tế bào cũng có thể được làm giàu quần bằng cách sử dụng flow cytometry cùng lúc trong quá trình chuẩn bị mẫu. Sau khi tế bào được rửa, có thể tiến hành tạo thư viện 10x ngay lập tức.
Tạo thư viện 10x
Bằng việc sử dụng các bộ kit thuốc thử và thiết bị Chromium của 10x Genomics thì vi giọt tế bào đơn được tạo ra mà trong mỗi vi giọt, quá trình phiên mã ngược diễn ra để tạo cDNA từ mRNA cũng như protein bề mặt của tế bào đơn; tất cả các cDNA đều có chung một 10x barcode đến từ tế bào ban đầu.
Giải trình tự
Thư viện được gắn 10x barcode tương thích với việc phân tích dữ liệu giải trình tự đoạn đọc ngắn của Illumina, cho phép lập hồ sơ song song hàng nghìn tế bào đơn.
Phân tích dữ liệu
Cell Ranger cho phép người dùng phân tích dữ liệu thu được từ biểu hiện gen và protein bề mặt tế bào.
Trực quan hóa dữ liệu
Loupe V(D)J Browser được sử dụng để xác định và so sánh các loại tế bào dựa trên biểu hiện gen và các loại protein bề mặt tế bào.
